Contexte : Les populations bactériennes présentes dans les préparations biodynamiques (BD500-BD507) peuvent contribuer à améliorer la santé du sol, le développement des plantes, le rendement et la qualité. Le présent travail décrit une étude métagénomique de ces préparations afin d’identifier les communautés bactériennes ainsi que la diversité des fonctions qui leur sont associées.

Résultats : Le séquençage du métagénome a été réalisé à l’aide de la plateforme Illumina MiSeq, qui utilise la technologie de séquençage de nouvelle génération (NGS), afin de comprendre les communautés bactériennes et leur diversité fonctionnelle dans les préparations biodynamiques (BD). Les données NGS des préparations BD ont révélé qu’un maximum d’unités taxonomiques opérationnelles (OTU) du phylum Proteobacteria était présent dans le BD506 (23429), suivi par le BD505 (22712) et BD501 (21591), respectivement. De plus, les phylum (16657) et les genres (16657) non classifiés sont également les plus nombreux dans le BD506. La diversité alpha maximale a été rapportée dans le BD501 (1095 OTU) et minimale dans le BD507 (257 OTU). En outre, les OTUs de cinq groupes fonctionnels métaboliques majeurs, à savoir le métabolisme des glucides, la dégradation des xénobiotiques, les fonctions de transport membranaire, le métabolisme énergétique et les activités enzymatiques, étaient abondantes dans les BD506 et BD501.

Conclusion : Les populations bactériennes des préparations BD506 et BD501 sont uniques et rares ; elles appartiennent à des catégories fonctionnelles impliquées dans l’activité enzymatique, le transport membranaire, la dégradation des xénobiotiques et le métabolisme des hydrates de carbone. On peut donc penser que ces préparations sont plus efficaces. L’enquête a également révélé une population bactérienne très variée, ce qui pourrait expliquer pourquoi les préparations BD fonctionnent bien sur le terrain. Dans ces conditions, les préparations BD peuvent être utilisées pour des communautés bactériennes inexploitées en vue d’une production agricole durable.

Informations sur l'étude originale (nous disposons ici de la traduction française de Biodynamie Recherche)

• Auteurs: Vaish, S., Soni S.K., Singh, B., Garg, N., Ahmad I.Z., Manoharan, M., Trivedi, A.K.
• Titre: Meta-analysis of biodynamic (BD) preparations reveal the bacterial population involved in improving soil health, crop yield and quality
• Journal: Journal of Genetic Engineering and Biotechnology 22 (2024) 100345
• Link: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1687157X23015160?via%3Dihub